La Agencia Canaria de Investigación, Innovación y Sociedad de la Información (ACIISI), la Universidad de La Laguna y la Fundación Canaria Empresa Universidad de La Laguna desarrollan los siguientes Proyectos Estructurantes:
- Proyecto de Estructurante Específico (Pee) en Agua- CONVAGUA
- Proyecto Estructurante en Neurociencia Cognitiva- NEUROCOG
- Proyecto de Estructurante Específico en Nanociencia, Nanotecnología y Materiales Avanzados- NANOMAC

Los objetivos generales del Proyecto CONVAGUA se centran en el establecimiento de estrategias de optimización de recursos humanos y de medios materiales para la consecución de los fines propios de la Comunidad Científica Canaria en cuanto a docencia e investigación de alto nivel, así como atender adecuadamente a las demandas de la sociedad canaria en todos los aspectos relacionados con el agua y sus aplicaciones.
A través de este proyecto se pretende conseguir la unificación de esfuerzos entre diferentes grupos de investigación, de distintas áreas de conocimiento, pero que tienen en común su interés por la temática 'AGUA' y sus aplicaciones.
Se pretende disponer y divulgar entre los Agentes del Agua en Canarias de la existencia de un amplio grupo interdisciplinar de investigación, coordinado, con infraestructura científica suficiente para abordar gran parte de los problemas que se demandan en el sector.

El objetivo principal del Proyecto NEUROCOG es establecer estrategias de optimización de recursos humanos y de medios materiales en el estudio de Procesos cerebrales determinantes de las funciones cognitivas, emocionales y psicosociales en individuos sanos y en pacientes psicopatológicos contribuyendo a configurar nuevos proyectos haciendo uso de las sinergias entre los grupos de investigación y las empresas.
En la sociedad canaria, especialmente en ambas universidades, hay varios grupos de neurocientíficos con una trayectoria excelente. Este proyecto pretende coordinar esfuerzos de más de 50 investigadores de la ULL y de la ULPGC, con el fin de desarrollar grandes líneas de investigación que sitúe a los investigadores canarios en la avanzadilla internacional de las neurociencias. El proyecto tiene una vertiente tecnológica ya que, al establecerse una colaboración entre científicos y empresarios, se podrán crear y desarrollar tecnologías con su consiguiente impacto económico y social.

El Proyecto NANOMAC surge con la idea de facilitar el intercambio y la transferencia de conocimientos entre los distintos agentes del sistema de ciencia-tecnología-empresa, de manera que se fomente la cooperación entre ellos. Esto propicia la creación de nuevos grupos temáticos, proyectos de investigación pluridisciplinares, plataformas tecnológicas, y mejora la coordinación entre las infraestructuras científico-tecnológicas, así como la vertebración de las comunidades científicas de cara al Espacio Europeo de Investigación.
Generar nuevos conocimientos básicos y aplicados en materiales y procesos con alto valor añadido y su transferencia a los sectores productivos de ámbito local, nacional y europeo son objeto de este proyecto. De modo adicional a lo anterior, está la formación de nuevos profesionales en el campo de los materiales y la divulgación del conocimiento científico.